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丽水市疾病预防控制中心是于2001年8月20日在原丽水市卫生防疫站基础上组建而成的，是政府举办的实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益事业单位，是全市疾病预防控制、卫生检验检测、健康教育、科研培训等业务技术的指导中心、科技研究中心、信息管理中心、人才培训中心。

中心现有编制数72人，目前在编72人，合同工16人。拥有高级以上职称专业技术人员18人；博士1人，硕士9人；省医坛新秀1名，市拔尖人才1名，市138第一层次培养人才2名、第二层次2名、第三层次1名，绿谷名医2名，绿谷医坛新秀3名。中心内设办公室等3个职能科室和传染病预防与控制科等8个业务科室，承担7大类、25个类别、78项内容和255个项目的市、区两级疾病预防控制工作职能。

中心占地面积12亩，建筑面积8954.25m2，其中实验室用房3834.9m2。中心现建有P2实验室、百级洁净实验室、病毒实验室和艾滋病确证实验室配备气质联机、高效液相色谱仪、PCR仪、微量元素分析仪、细菌鉴定仪、全自动血球计数仪等高精仪器设备。

近年来，市疾控中心先后获得省卫生应急工作先进单位、省疾病预防控制工作先进集体、省监测项目工作先进单位等称号；1个科研项目列入省政府科技计划、1个项目列入科技厅公益性技术应用研究计划、8个列入省医药卫生科技基金、7个列入市政府科技计划，并获得中华预防医学会科学技术奖二等奖1项、省科学技术三等奖1项、省医药卫生科技三等奖5项、丽水市科学技术进步一等奖和三等奖各1项。

中心将继续秉承“人文、自励、人本、和谐”的文化理念，着力于干部队伍建设、专业人才队伍建设、党的建设、文化建设和业务建设，达到“监测引导工作、科研提升水平、狠抓基础基本、分清主次干预、人文精神改观”的跨越式发展目标，为全市社会和经济的发展提供强有力的公共卫生技术保障。